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云南大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)穿山甲新物種
近日，云南大學(xué)省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室于黎研究員、胡靖揚(yáng)助理研究員在國(guó)際頂級(jí)醫(yī)學(xué)期刊《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》（PNAS）雜志上在線發(fā)表了一篇題為《基因組分析揭示了一個(gè)神秘的穿山甲物種》的文章。研究團(tuán)隊(duì)基于目前最大規(guī)模的穿山甲群體基因組學(xué)數(shù)據(jù)，并聯(lián)合穿山甲鱗片的形態(tài)學(xué)分析，證實(shí)了一個(gè)新的穿山甲物種的存在，極大地刷新和擴(kuò)展了目前對(duì)穿山甲物種多樣性和演化歷史的認(rèn)知。
在查獲樣品中發(fā)現(xiàn)的穿山甲新物種鱗片。圖片來(lái)源：楊鋒(中國(guó)香港特別行政區(qū)嘉道理農(nóng)場(chǎng)植物園)
穿山甲（pangolin）是世界上非法貿(mào)易最嚴(yán)重的野生哺乳動(dòng)物，包括8個(gè)穿山甲物種（4個(gè)亞洲穿山甲：馬來(lái)穿山甲、中華穿山甲、印度穿山甲和菲律賓穿山甲；4個(gè)非洲穿山甲：樹(shù)穿山甲、長(zhǎng)尾穿山甲、大穿山甲和南非穿山甲）。所有穿山甲均已被列入IUCN瀕危物種紅色名錄。云南大學(xué)于黎研究員團(tuán)隊(duì)和香港嘉道理農(nóng)場(chǎng)暨植物園張華榮博士團(tuán)隊(duì)在對(duì)云南和香港分別查獲的非法貿(mào)易的穿山甲鱗片進(jìn)行分子物種鑒定時(shí)，都發(fā)現(xiàn)了不同于已知的8個(gè)穿山甲物種的新的線粒體單倍型，提示可能存在穿山甲新物種。進(jìn)一步對(duì)所有已知的穿山甲物種和可能的新物種進(jìn)行了鱗片形態(tài)特征比較以及138個(gè)個(gè)體的群體基因組分析，證實(shí)其為新的亞洲穿山甲物種，即世界第九種穿山甲，并將其命名為Manis mysteria（the Asian mysterious pangolin），而這距離上一個(gè)穿山甲物種--菲律賓穿山甲的發(fā)現(xiàn)已過(guò)去百年。
研究團(tuán)隊(duì)首先通過(guò)對(duì)這一神秘物種的鱗片的形態(tài)特征分析發(fā)現(xiàn)其具有典型亞洲穿山甲特征，不具有非洲穿山甲的特征，據(jù)此將其歸類于亞洲穿山甲。
基于8個(gè)已知穿山甲物種和新物種的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建（A和B)、基因組差異比較（C）、物種界定分析（D）、基因組分化島分析（E）、群體歷史重構(gòu)（F）、遺傳多樣性分析（G）、近交水平評(píng)估（H）、和有害突變?cè)u(píng)估（I和J）
隨后，研究團(tuán)隊(duì)從基因組學(xué)視角，開(kāi)展了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建、基因組差異比較、物種劃界、基因組分化島和分歧時(shí)間估算等分析，所有結(jié)果都支持這一新發(fā)現(xiàn)的類群是不同于目前已知的所有八個(gè)穿山甲物種的新物種，即世界第九種穿山甲，第五種亞洲穿山甲。該物種早在500多萬(wàn)年前就與菲律賓穿山甲和馬來(lái)穿山甲分化。種群歷史分析發(fā)現(xiàn)該物種受更新世冰川作用和近期人類活動(dòng)的影響，經(jīng)歷了兩次瓶頸效應(yīng)，表現(xiàn)為與已知穿山甲物種不同的進(jìn)化歷史。由于目前發(fā)現(xiàn)的新物種均來(lái)自查獲的鱗片，提示著新物種與其他穿山甲物種一樣，也正在經(jīng)歷著非法狩獵和非法貿(mào)易的嚴(yán)重威脅，加速了其種群數(shù)量的縮減?；蚪M特征分析顯示，新物種在所有穿山甲物種中呈現(xiàn)出相對(duì)較低的遺傳多樣性，較高水平的近交程度和有害突變積累，也再次提示其種群數(shù)量較少，演化潛力低，與其他穿山甲物種一樣面臨類似的生存困境。因此，迫切需要盡快找到該物種，并制定科學(xué)合理的保護(hù)措施。研究人員提出該新物種的兩個(gè)可能的分布地，一個(gè)是基于研究分析中檢測(cè)到新物種與中華穿山甲和印度穿山甲之間曾經(jīng)發(fā)生過(guò)基因交流，提出了新物種的分布地可能與這兩個(gè)物種的分布地重疊或相鄰；另一個(gè)是由于香港和云南查獲的亞洲穿山甲主要來(lái)自東南亞島嶼，而且新物種又是和其他亞洲穿山甲一起被查獲，提出東南亞島嶼也可能是其潛在的分布地。
云南大學(xué)于黎研究員、胡靖揚(yáng)助理研究員，香港嘉道理農(nóng)場(chǎng)暨植物園張華榮博士，北京大學(xué)羅述金研究員為論文的共同通訊作者，云南大學(xué)谷桐桐博士為論文的第一作者。（記者 陳怡希）
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