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生物是按“級”進行分類的。首先，按生物最基本的區(qū)別，把生物分成不同的“界”，這是生物最大的一級分類單位；然后，按界內(nèi)生物最基本的區(qū)別把界內(nèi)生物分成不同的“門”；依次往下，進行門內(nèi)分“綱”、綱內(nèi)分“目”、目內(nèi)分“科”、科內(nèi)分“屬”和屬內(nèi)分“種”，種是生物最小的一級分類單位或基本單位。

生物的界級分類隨著人們研究技術的改進和認識的深入，從先到后大致提出了如下幾個分類系統(tǒng)：

1 兩界系統(tǒng)

瑞典生物學家林奈(1707～1778)，注意到周圍的生物有固著不動和自養(yǎng)型的植物，也有自由行動和異養(yǎng)型的動物。因此，他把整個生物分成相應的兩大類：植物界和動物界，即所謂的兩界分類系統(tǒng)。該系統(tǒng)把細菌類、藻類和真菌類歸入植物界，把原生動物類歸入動物界。在分類上，這個系統(tǒng)自問世以來，一直沿用到20世紀50年代。

2 三界系統(tǒng)

在二界分類系統(tǒng)，對于原生動物，如我們熟悉的草履蟲、變形蟲和瘧原蟲等，因它們能自由運動和屬異養(yǎng)型，歸入動物界；一些藻類，如裸藻和甲藻，因它們不能自由行動和屬自養(yǎng)型，歸入植物界。但它們有一共同的基本特點：單細胞生物，在結構上遠比多細胞的動物和植物簡單。所以，1866年，德國生物學家海克爾(E·H·Haeckel)，從進化觀點，在兩界分類系統(tǒng)的基礎上又增加1個原生生物界，包括單細胞動物和其他一些難以歸入動物界或植物界的單細胞生物，作為植物界和動物界的祖先。這個三界(原生生物界、植物界和動物界)分類系統(tǒng)，初步地反映了生物進化的途徑。

3 四界系統(tǒng)

在三界分類系統(tǒng)，只因真菌類(如我們?nèi)粘Ｊ秤玫哪⒐揭约斑z傳上常用的實驗材料粗糙脈孢菌和面包酵母)固著生活和有細胞壁而歸入植物界。但真菌細胞壁的化學組成是幾丁質(zhì)(而不是纖維素)，儲存的是糖原(而不是淀粉)，這些都有別于其他植物。真菌雖為異養(yǎng)型，但主要為腐生或寄生，有別于動物的異養(yǎng)攝生或異養(yǎng)攝食；真菌為細胞外消化，即把其消化酶分泌到食物上，在胞外把食物分解后再吸收到胞內(nèi)供利用，也有別于動物的細胞內(nèi)消化。由于真菌與植物和動物的上述明顯差異，所以在1959年惠特克(R·H·Whittaker)提出了另立1個真菌界的四界(原生生物界、真菌界、植物界和動物界)分類系統(tǒng)。

4 五界系統(tǒng)

隨著顯微鏡技術的發(fā)展，可把細胞分成兩大類：原核細胞和真核細胞。原核細胞很小，其體積約為真核細胞的千分之一；原核細胞染色體為裸露DNA(即沒有與蛋白質(zhì)結合)，其周圍也沒有膜與細胞其他部分隔開(即為原核)，真核細胞染色體為DNA和蛋白質(zhì)的結合物，且有核膜與細胞其他部分隔開(即為真核)。這兩大類細胞的差異，反映了生物進化的不同水平，所以惠特克于1969年又提出了五界分類系統(tǒng)：原核生物界，包括細菌和其他原核生物；原生生物界，包括單細胞真核生物，如原生動物和多數(shù)藻類；真菌界；植物界；動物界。這是目前應用最為廣泛的分類系統(tǒng)，因它基本上反映了地球細胞生物的進化歷程。在結構上，從原核生物界進化到單細胞的真核生物(原生生物界)，再進化到多細胞的真核生物；在營養(yǎng)上，從異養(yǎng)生物進化到自養(yǎng)和異養(yǎng)共存，構成了一個完善的物質(zhì)和能量循環(huán)體系。

5 兩總界五界分類系統(tǒng)

我國學者陳世驤等認為，上述五界分類系統(tǒng)把原生生物界列為一個中間階段，削弱了原核與真核兩個基本階段的對比性；在原核生物界和原生生物界內(nèi)，也沒有考慮生態(tài)關系。為此，去掉原生生物界而成為兩總界五界分類系統(tǒng)：原核總界(分為細菌界和藍藻界)和真核總界(分為植物界、真菌界和動物界)；原來屬于原生生物界的生物，依情況分屬到植物界、真菌界和動物界。

6 六界分類系統(tǒng)

隨著分子生物學技術的進步，人們發(fā)現(xiàn)在五界分類系統(tǒng)中，原核界的細菌在形態(tài)上盡管很相似，但根據(jù)分子水平上的差異可明顯分成兩大類：古細菌和真細菌。例如，在古細菌中，存在TATA鍵合蛋白盒子(ATTA box-bindingprotein)，這也是真核生物中RNA多聚酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的基本轉(zhuǎn)錄因子，但在真細菌中卻沒有這種轉(zhuǎn)錄因子。又如，在核糖體RNA(rRNA)的同源性上，在細胞壁和細胞膜的成分上，以及在轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)稀有堿基的差別上，古細菌和真細菌都有明顯不同；這個不同甚至要超過它們各自與真核生物的不同。所以，沃斯(C·R·Woese)認為，應把原核生物界分類兩界：古細菌界和真細菌界。古細菌界的細菌主要生活在一些極端環(huán)境中，如沼澤地底層(甲烷細菌)、熱泉(如布氏火盤菌，最適生長溫度達105 ℃)等。真細菌界的細菌為常見類型，有共生的，如遺傳研究的重要細菌大腸桿菌；有寄生和致病的，如沙門氏菌和葡萄球菌。真細菌界還包括藍綠藻。

關于六界間的生物在進化上的關系，沃斯根據(jù)它們在分子水平上的差異認為，所有生物有3種最基本的類型：古細菌、真細菌和最簡單的真核生物。由于它們彼此間在分子水平上的差異大小近于相等，所以它們可能或多或少直接起源于地球上的原始生命，即原始生命在自然選擇過程中，或遲或早地出現(xiàn)了這3種類型的獨立進化途徑。

開始，可能古細菌在地球上占優(yōu)勢，因為它們的代謝很好地適應了原始地球條件(富有二氧化碳，缺氧、高溫)。往后，當氧成為大氣的主要成分和地球溫度逐漸變冷時，適合于需氧和較低溫度的真細菌又可能占優(yōu)勢。關于真核細胞的起源一直是個謎。根據(jù)分析，真核生物葉綠體的RNA和藍綠藻的RNA極為相似，而有些真核細胞的基因又與古細菌的極為相似，所以最簡單的真核生物可能有復雜的起源，即原始生命、古細菌和真細菌都可能參與了這一過程，再后，最簡單的真核生物，在長期的自然選擇過程中又進化成四界：原生生物界、植物界、真菌界和動物界。

病毒是結構上極為簡單的非細胞生物。病毒是生物，是因它具有生命的某些特征，如借助于宿主細胞可以進行繁殖，以產(chǎn)生更多的病毒。但其簡單的結構，到底是原始地球上的最初生命形式，還是原核界生物退化的產(chǎn)物，現(xiàn)尚無定論，從而也還不能確定其分類地位。